母乳中蛋白质含量约为0 . 9 - 2 . 0 % ， 非蛋白氮为0.09-0.12%。母乳中蛋白质构成是以乳清蛋白为主，没有乳球蛋白，酪蛋白较少；牛奶正相反，酪蛋白多，乳清蛋白少。

母乳中的胱氨酸、牛磺酸含量也远高于牛奶。牛奶还含有大量的乳球蛋白，酪氨酸与苯丙氨酸含量都大于母乳。母乳中核苷酸较牛奶多许多，核苷酸对于蛋白质的合成是起重要作用的，其中高分子量的核苷酸是它的中间体。

从热量分配上看母乳蛋白质提供的热量占13%，而牛奶蛋白质提供的热量占20%。母乳与牛奶在脂肪含量上大致相同，但脂肪酸组成有很大差别，牛奶中饱和脂肪酸比较多，而母乳中不饱和脂肪酸特别是亚油酸和亚麻酸比较多。母乳中的乳糖含量高于牛奶，母乳中的含量约为7％，而牛奶中的乳糖含量为4.5-4.8%。

此外，母乳与牛奶相比，含有更丰富的乳铁蛋白、溶菌酶、免疫球蛋白、各种生长因子，这些对于婴儿的健康成长和发育至关重要。